Też chyba tak zrobię, że postawię na nowo, tak to już jest jak serwer stoi 6 lat i się nic w nim nie aktualizuje (bo i po co jak działa).
Teraz serwer nie jest już potrzebny to dla zabawy stawiam Gentoo na nowo.
Jeśli masz wystarczająco dużo miejsca stawiaj na spokojnie system obok w chroocie. Później tylko przenosisz całość na docelową partycję. Szkoda zdrowia, nerwów i czasu na standardowy upgrade z tak starej wersji.