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Problemi di memoria - Importante!! [SOLVED]
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pigreco
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 7:41 am    Post subject: Problemi di memoria - Importante!! [SOLVED] Reply with quote

Salve,
ieri ho avuto un pò di problemi su di un mio server, mi si chiudevano i servizi improvvisamente, con errori di out of memory o impossibilità allocare la memoria.
Considerando che il sistema è in servizio da un bel pò senza grossi problemi non riesco a capire cosa può essere accaduto 8O
Controllando con 'top' ho notato che la memoria swap è a zero:
Code:
top - 10:13:27 up  7:58,  2 users,  load average: 0.00, 0.00, 0.00
Tasks: 189 total,   1 running, 185 sleeping,   3 stopped,   0 zombie
Cpu(s):  0.1%us,  1.3%sy,  0.0%ni, 98.6%id,  0.0%wa,  0.0%hi,  0.0%si,  0.0%st
Mem:   2055060k total,  2014496k used,    40564k free,   265072k buffers
[b]Swap:        0k total,        0k used,        0k free,   779436k cached[/b]

non ricordo bene come era in precedenza ma ho altri server linux gentoo praticamente gemelli come configurazione ed utilizzano la memoria swap correttamente.
La partizione di swap è presente nel sistema:
Quote:

cat /etc/fstab
# /etc/fstab: static file system information.
#

# <fs> <mountpoint> <type> <opts> <dump/pass>

# NOTE: If your BOOT partition is ReiserFS, add the notail option to opts.
/dev/sda1 /boot ext2 noauto,noatime 1 2
/dev/sda3 / ext3 noatime 0 1
/dev/sda2 none swap sw 0 0
/dev/cdroms/cdrom0 /mnt/cdrom iso9660 noauto,ro 0 0
#/dev/fd0 /mnt/floppy auto noauto 0 0

# NOTE: The next line is critical for boot!
proc /proc proc defaults 0 0
shm /dev/shm tmpfs nodev,nosuid,noexec 0 0
LABEL=/tmp /tmp ext3 defaults,nosuid,noexec 1 2



fdisk -l

Disco /dev/sda: 500.0 GB, 499999834112 byte

255 testine, 63 settori/tracce, 60788 cilindri
Unit? = cilindri di 16065 * 512 = 8225280 byte
Identificativo disco: 0x00000080

Dispositivo Boot Start End Blocks Id System
/dev/sda1 * 1 7 56196 83 Linux
/dev/sda2 8 257 2008125 82 Linux swap / Solaris
/dev/sda3 258 60788 486215257+ 83 Linux


però sembra non essere utilizzata
Code:
swapon -s
Filename            Type      Size   Used   Priority

Ho tentato un riavvio senza ottenere nessun miglioramento.

La cosa mi preoccupa molto :cry: e se qualcuno ha dei sugerimenti per aiutarmi a risolverela cosa, come identifcare un eventuale causa o come riattivare la swap gli sarei molto grato se mi potesse aiutare.

Grazie in anticipo,
Maurizio


Last edited by pigreco on Mon Apr 19, 2010 9:20 am; edited 1 time in total
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desultory
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 8:04 am    Post subject: Reply with quote

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Peach
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 8:13 am    Post subject: Re: Problemi di memoria - Importante!! Reply with quote

pigreco wrote:
Ho tentato un riavvio senza ottenere nessun miglioramento.

ciao Maurizio
immagino che il problema possa essere preoccupante, ma ho dei dubbi
Innanzi tutto quello che dici significa che al riavvio ti ritrovi tutto lo swap occupato?
se no, quanto ci mette?
l'output del kernel riporta qualcosa? (apparte l'OOM)
se posso ti consiglierei di usare htop per tenere d'occhio la memoria e quanto tempo ci mette a finire e grazie a chi.

facci sapere.
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pigreco
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 8:28 am    Post subject: Reply with quote

Ciao Peach, grazie per la risposta,
quando ho scritto del riavvio intendevo che la swap era a zero k prima e lo è anche dopo aver riavviato, non ci sono + stati episodi di chiusura di servizi o errori di out of memory per il momento.
Scusate l'ignoranza ma non avevi mai usato htop, anche lui conferma che non c'è utilizzo della memoria swap:

Code:
  1  [                                                                                   0.0%]     Tasks: 143 total, 1 running
  2  [                                                                                   0.0%]     Load average: 0.11 0.13 0.06
  3  [|                                                                                  0.7%]     Uptime: 08:52:36
  4  [                                                                                   0.0%]
  Mem[|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||826/2006MB]
  Swp[                                                                                  0/0MB]
.........


per quanto riguarda l'output del kernel, non ho + niente dal riavvio, posso allegare un output precedente visualizzato al crash di mysql:
Code:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: mysqld invoked oom-killer: gfp_mask=0x4d0, order=2, oomkilladj=0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: mysqld invoked oom-killer: gfp_mask=0x4d0, order=2, oomkilladj=0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Pid: 12178, comm: mysqld Not tainted 2.6.31-gentoo-r6 #5
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Pid: 12178, comm: mysqld Not tainted 2.6.31-gentoo-r6 #5
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Call Trace:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Call Trace:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8107fc9f>] ? oom_kill_process+0x7b/0x215
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8107fc9f>] ? oom_kill_process+0x7b/0x215
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81080038>] ? __out_of_memory+0x3c/0x14b
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81080038>] ? __out_of_memory+0x3c/0x14b
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8108020f>] ? out_of_memory+0xc8/0x125
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8108020f>] ? out_of_memory+0xc8/0x125
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81082f19>] ? __alloc_pages_nodemask+0x446/0x4f0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81082f19>] ? __alloc_pages_nodemask+0x446/0x4f0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a6135>] ? kmem_getpages+0x52/0x11a
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a6135>] ? kmem_getpages+0x52/0x11a
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a678e>] ? fallback_alloc+0x10f/0x1a9
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a678e>] ? fallback_alloc+0x10f/0x1a9
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a6344>] ? kmem_cache_alloc_node+0xae/0x125
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a6344>] ? kmem_cache_alloc_node+0xae/0x125
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a63f1>] ? __kmalloc_node+0x36/0x82
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810a63f1>] ? __kmalloc_node+0x36/0x82
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f8c61>] ? __alloc_skb+0x64/0x153
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f8c61>] ? __alloc_skb+0x64/0x153
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f48d5>] ? sock_alloc_send_pskb+0x81/0x2ab
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f48d5>] ? sock_alloc_send_pskb+0x81/0x2ab
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81622654>] ? thread_return+0x3f/0xaa
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81622654>] ? thread_return+0x3f/0xaa
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81594464>] ? unix_stream_sendmsg+0x16c/0x30e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81594464>] ? unix_stream_sendmsg+0x16c/0x30e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f1aae>] ? sock_aio_write+0xd1/0xe0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff814f1aae>] ? sock_aio_write+0xd1/0xe0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810ac0ea>] ? do_sync_write+0xc9/0x10c
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810ac0ea>] ? do_sync_write+0xc9/0x10c
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8105127d>] ? autoremove_wake_function+0x0/0x2e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8105127d>] ? autoremove_wake_function+0x0/0x2e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81092614>] ? handle_mm_fault+0x323/0x6a4
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff81092614>] ? handle_mm_fault+0x323/0x6a4
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810ac7d5>] ? vfs_write+0xc0/0x149
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810ac7d5>] ? vfs_write+0xc0/0x149
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810acd0a>] ? sys_write+0x45/0x6e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff810acd0a>] ? sys_write+0x45/0x6e
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8100adab>] ? system_call_fastpath+0x16/0x1b
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: [<ffffffff8100adab>] ? system_call_fastpath+0x16/0x1b
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Mem-Info:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Mem-Info:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32 per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32 per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32 per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32 per-cpu:
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:   0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Active_anon:221331 active_file:34 inactive_anon:225722
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Active_anon:221331 active_file:34 inactive_anon:225722
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: inactive_file:33 unevictable:0 dirty:0 writeback:0 unstable:0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: inactive_file:33 unevictable:0 dirty:0 writeback:0 unstable:0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: free:16773 slab:12910 mapped:6606 pagetables:30626 bounce:0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: free:16773 slab:12910 mapped:6606 pagetables:30626 bounce:0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA free:4008kB min:40kB low:48kB high:60kB active_anon:5540kB inactive_anon:5720kB active_file:4kB inactive_file:16kB unevictable:0kB present:15364kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA free:4008kB min:40kB low:48kB high:60kB active_anon:5540kB inactive_anon:5720kB active_file:4kB inactive_file:16kB unevictable:0kB present:15364kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 994 994 994
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 994 994 994
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32 free:43576kB min:2828kB low:3532kB high:4240kB active_anon:413624kB inactive_anon:423008kB active_file:68kB inactive_file:0kB unevictable:0kB present:1018080kB pages_scanned:22 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32 free:43576kB min:2828kB low:3532kB high:4240kB active_anon:413624kB inactive_anon:423008kB active_file:68kB inactive_file:0kB unevictable:0kB present:1018080kB pages_scanned:22 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32 free:19508kB min:2872kB low:3588kB high:4308kB active_anon:466160kB inactive_anon:474160kB active_file:64kB inactive_file:184kB unevictable:0kB present:1033196kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32 free:19508kB min:2872kB low:3588kB high:4308kB active_anon:466160kB inactive_anon:474160kB active_file:64kB inactive_file:184kB unevictable:0kB present:1033196kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA: 72*4kB 55*8kB 21*16kB 26*32kB 1*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 1*2048kB 0*4096kB = 4008kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA: 72*4kB 55*8kB 21*16kB 26*32kB 1*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 1*2048kB 0*4096kB = 4008kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32: 10278*4kB 301*8kB 4*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 43584kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 0 DMA32: 10278*4kB 301*8kB 4*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 43584kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32: 3687*4kB 604*8kB 0*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 19580kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Node 1 DMA32: 3687*4kB 604*8kB 0*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 19580kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 8271 total pagecache pages
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 8271 total pagecache pages
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 0 pages in swap cache
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 0 pages in swap cache
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Free swap  = 0kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Free swap  = 0kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Total swap = 0kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Total swap = 0kB
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 524024 pages RAM
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 524024 pages RAM
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 10259 pages reserved
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 10259 pages reserved
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 756736 pages shared
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 756736 pages shared
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 450345 pages non-shared
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: 450345 pages non-shared
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Out of memory: kill process 7918 (mysqld) score 108091 or a child
Apr 18 16:12:37 etaromtre kernel: Killed process 7918 (mysqld)


io purtroppo di kernel ci capisco poco e ho notato solo il legame con la memoria, ma ripeto dal riavvio se non fosse per il persistere della swap a 0k sembra tutto ok.

Aggiungo che ho tentato l'attivazione della swap con:
Code:
swapon -a

ottenendo lo sconfortante risultato, che non so ben collocare o rimediare:

Code:
swapon: /dev/sda2: swapon failed: Invalid argument


Maurizio


Last edited by pigreco on Mon Apr 19, 2010 8:38 am; edited 2 times in total
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riverdragon
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 8:36 am    Post subject: Reply with quote

swapon /dev/sda2 che dice?
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pigreco
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 8:57 am    Post subject: Reply with quote

Code:
swapon /dev/sda2
swapon: /dev/sda2: swapon failed: Invalid argument


:cry:
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pigreco
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 9:20 am    Post subject: Reply with quote

:D :D risolto con:
Code:
#mkswap /dev/sda2
mkswap: /dev/sda2: warning: don't erase bootbits sectors
        (DOS partition table detected). Use -f to force.
Setting up swapspace version 1, size = 2008120 KiB
nessuna etichetta, UUID=6180924d-e4e0-4961-a4eb-e187c4d57894

 #swapon /dev/sda2


mi rimane il grande dubbio di cosa possa essere successo ma per adesso mi accontento di aver riattivato la swap....

Code:
top - 12:06:13 up  9:51,  3 users,  load average: 0.04, 0.06, 0.01
Tasks: 192 total,   1 running, 184 sleeping,   7 stopped,   0 zombie
Cpu(s):  0.2%us,  0.2%sy,  0.0%ni, 99.6%id,  0.1%wa,  0.0%hi,  0.0%si,  0.0%st
Mem:   2055060k total,  1981932k used,    73128k free,   292008k buffers
Swap:  2008116k total,        0k used,  2008116k free,   796960k cached


grazie tante a tutti voi,

Maurizio
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djinnZ
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 2:56 pm    Post subject: Reply with quote

credo che hai appena scoperto perchè la swap è meglio che stia in una partizione dedicata...
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pigreco
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 3:30 pm    Post subject: Reply with quote

Quote:
credo che hai appena scoperto perchè la swap è meglio che stia in una partizione dedicata...

vuoi dire che può essere instabile e sono cose che possono capitare?

ciao
Maurizio
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djinnZ
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PostPosted: Mon Apr 19, 2010 5:59 pm    Post subject: Reply with quote

La swap per tante ragioni è molto delicata e può facilmente essere corrotta visto che è sottoposta a scritture dirette (almeno questa è la ragione "storica"). Mi è capitato che si corrompesse (e su un certo sistema inoperativo si è portata dietro il sistema ma è altra questione)

Verifica se non hai attivato lo swap erase nella configurazione dell'rc (dipende dalle versioni), una volta mi pare che c'era qualche problemino.

Prova a ricrearla con
Code:
mkswap -c -v1 /dev/sda2
, niente di più facile che sia a causa di qualche bad sector che viene corrotta.

Ti direi di provare anche con -f ma ho il timore che ci sia qualche problema di allocazione delle partizioni, controlla. oppure ricreala dopo un
Code:
dd if=/dev/zero of=/dev/sda2

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pigreco
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PostPosted: Tue Apr 20, 2010 7:12 am    Post subject: Reply with quote

Quindi ritieni che dovrei provare ad intervenire come mi hai suggerito?
sono un pò timoroso dato che adesso tutto sembra funzionare correttamente e la partizione è utilizzata dal sistema.

Grazie per il prezioso aiuto.
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djinnZ
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PostPosted: Tue Apr 20, 2010 9:52 am    Post subject: Reply with quote

Azzerare (a servizi fermi e dopo uno swapoff) con dd la partizione di swap e ricrearla con il check per i bad-block (-c) non ti può creare problemi. Con -f se le partizioni sono sballate rischi e di brutto.
Se non altro escludi un problema al disco (potrebbe pure essere un chipset del piffero con problemi di overload come il mio) che è l'unica ipotesi preoccupante. A questo punto se tutto va bene vuol dire che è capitato. Non è frequente ma non è nulla di problematico.
Possibile pure che la vecchia swap era stata creata come v0 se è per questo.
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