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mattes
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Joined: 23 Jul 2008
Posts: 254
Location: München, Bavaria, Germany

PostPosted: Thu Dec 06, 2018 2:46 pm    Post subject: Out of Memory Reply with quote

Hallo, seit einigen Wochen habe ich ein Porblem, dass der Arbeitsspeicher ausgeht. (12Gb incl SWAP).
Laut top genehmigt sich /usr/bin/x den ganzen Speicher. Das Vehalten ist so, dass es mit der Zeit lamgsam volläuft und nach ca 2h ist dann der Speicher aus.
Per google hab ich gefunden dass firefox dazu beitragen kann, bin mal einige Tage auf Chome ausgewichen, keine Änderung. Auch neumergen von Kernel, KDE, xorg, hat nichts gebracht.
Wie kann ich das denn debuggen, oder hat Jemand eine Idee woran das liegen kann?
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mike155
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Joined: 17 Sep 2010
Posts: 665
Location: Frankfurt, Germany

PostPosted: Thu Dec 06, 2018 3:21 pm    Post subject: Reply with quote

Klingt nach einem Memory Leak...

1) Welchen Grafikchip hast Du und welchen Grafiktreiber verwendest Du?

2) Bitte suche aus der Ausgabe von 'top' oder 'ps -guxa' die process-id (pid) des Prozesses, der Speicher verbraucht, und poste dann das Ergebnis von 'cat /proc/<pid>/status'.

3) Bitte poste auch die Ausgabe von 'emerge --info'.
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mattes
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Joined: 23 Jul 2008
Posts: 254
Location: München, Bavaria, Germany

PostPosted: Thu Dec 06, 2018 5:32 pm    Post subject: Reply with quote

Denke ich auch.

1)
GeForce GTX 560
Code:

[I] x11-drivers/nvidia-drivers
Installierte Versionen: 390.87(0/390)^md(17:01:03 02.12.2018)(X acpi driver gtk3 kms multilib tools -compat -pax_kernel -static-libs -uvm -wayland ABI_MIPS="-n32 -n64 -o32" ABI_PPC="-32 -64" ABI_S390="-32 -64" ABI_X86="32 64 -x32" KERNEL="linux -FreeBSD")


2)
Code:

 $ cat /proc/4609/status
Name:   X
Umask:  0022
State:  S (sleeping)
Tgid:   4609
Ngid:   0
Pid:    4609
PPid:   4599
TracerPid:      0
Uid:    0       0       0       0
Gid:    0       0       0       0
FDSize: 128
Groups: 
NStgid: 4609
NSpid:  4609
NSpgid: 4609
NSsid:  4609
VmPeak:  5762912 kB
VmSize:  5762912 kB
VmLck:         0 kB
VmPin:         0 kB
VmHWM:   5103848 kB
VmRSS:   5103848 kB
RssAnon:           19964 kB
RssFile:           24952 kB
RssShmem:        5058932 kB
VmData:    61672 kB
VmStk:       184 kB
VmExe:      2244 kB
VmLib:     60944 kB
VmPTE:     10572 kB
VmPMD:        32 kB
VmSwap:        0 kB
Threads:        6
SigQ:   0/31913
SigPnd: 0000000000000000
ShdPnd: 0000000000000000
SigBlk: 0000000000000000
SigIgn: 0000000000001000
SigCgt: 00000001c18066ef
CapInh: 0000000000000000
CapPrm: 0000003fffffffff
CapEff: 0000003fffffffff
CapBnd: 0000003fffffffff
CapAmb: 0000000000000000
NoNewPrivs:     0
Seccomp:        0
Speculation_Store_Bypass:       vulnerable
Cpus_allowed:   f
Cpus_allowed_list:      0-3
Mems_allowed:   1
Mems_allowed_list:      0
voluntary_ctxt_switches:        734329
nonvoluntary_ctxt_switches:     104000


3)
Code:

emerge --info
Portage 2.3.51 (python 2.7.15-final-0, default/linux/amd64/17.0/desktop/plasma, gcc-7.3.0, glibc-2.27-r6, 4.14.83-gentoo x86_64)
=================================================================
System uname: Linux-4.14.83-gentoo-x86_64-Intel-R-_Core-TM-2_Quad_CPU_Q9550_@_2.83GHz-with-gentoo-2.6
KiB Swap:    4194300 total,   4180732 free
Timestamp of repository gentoo: Thu, 06 Dec 2018 14:45:01 +0000
Head commit of repository gentoo: 9a2cfeff12a9b8d79ffb61e1dbb05fbcac8995ec
sh bash 4.4_p12
ld GNU ld (Gentoo 2.30 p5) 2.30.0
ccache version 3.3.4 [enabled]
app-shells/bash:          4.4_p12::gentoo
dev-java/java-config:     2.2.0-r4::gentoo
dev-lang/perl:            5.24.3-r1::gentoo
dev-lang/python:          2.7.15::gentoo, 3.6.5::gentoo
dev-util/ccache:          3.3.4-r1::gentoo
dev-util/cmake:           3.9.6::gentoo
dev-util/pkgconfig:       0.29.2::gentoo
sys-apps/baselayout:      2.6-r1::gentoo
sys-apps/openrc:          0.38.3::gentoo
sys-apps/sandbox:         2.13::gentoo
sys-devel/autoconf:       2.13::gentoo, 2.69-r4::gentoo
sys-devel/automake:       1.11.6-r3::gentoo, 1.15.1-r2::gentoo
sys-devel/binutils:       2.30-r4::gentoo
sys-devel/gcc:            7.3.0-r3::gentoo
sys-devel/gcc-config:     1.8-r1::gentoo
sys-devel/libtool:        2.4.6-r3::gentoo
sys-devel/make:           4.2.1-r4::gentoo
sys-kernel/linux-headers: 4.13::gentoo (virtual/os-headers)
sys-libs/glibc:           2.27-r6::gentoo
Repositories:

gentoo
    location: /usr/portage
    sync-type: rsync
    sync-uri: rsync://rsync.de.gentoo.org/gentoo-portage
    priority: -1000
    sync-rsync-verify-jobs: 1
    sync-rsync-verify-metamanifest: yes
    sync-rsync-extra-opts:
    sync-rsync-verify-max-age: 24

brother-overlay
    location: /usr/local/portage/layman/brother-overlay
    masters: gentoo
    priority: 50

desktop-effects
    location: /usr/local/portage/layman/desktop-effects
    masters: gentoo
    priority: 50

eclipse
    location: /usr/local/portage/layman/eclipse
    masters: gentoo
    priority: 50

ACCEPT_KEYWORDS="amd64"
ACCEPT_LICENSE="*"
CBUILD="x86_64-pc-linux-gnu"
CFLAGS="-march=core2 -O2 -pipe -fomit-frame-pointer -msse3"
CHOST="x86_64-pc-linux-gnu"
CONFIG_PROTECT="/etc /home/matthias /usr/lib64/libreoffice/program/sofficerc /usr/share/config /usr/share/gnupg/qualified.txt /usr/share/maven-bin-3.3/conf"
CONFIG_PROTECT_MASK="/etc/ca-certificates.conf /etc/dconf /etc/env.d /etc/fonts/fonts.conf /etc/gconf /etc/gentoo-release /etc/init.d /etc/php/apache2-php7.2/ext-active/ /etc/php/cgi-php7.2/ext-active/ /etc/php/cli-php7.2/ext-active/ /etc/revdep-rebuild /etc/sandbox.d /etc/splash /etc/terminfo /etc/texmf/language.dat.d /etc/texmf/language.def.d /etc/texmf/updmap.d /etc/texmf/web2c"
CXXFLAGS="-march=core2 -O2 -pipe -fomit-frame-pointer -msse3"
DISTDIR="/usr/portage/distfiles"
EMERGE_DEFAULT_OPTS="--with-bdeps=y"
ENV_UNSET="DBUS_SESSION_BUS_ADDRESS DISPLAY GOBIN PERL5LIB PERL5OPT PERLPREFIX PERL_CORE PERL_MB_OPT PERL_MM_OPT XAUTHORITY XDG_CACHE_HOME XDG_CONFIG_HOME XDG_DATA_HOME XDG_RUNTIME_DIR"
FCFLAGS="-O2 -pipe"
FEATURES="assume-digests binpkg-logs buildsyspkg ccache config-protect-if-modified distlocks ebuild-locks fixlafiles merge-sync multilib-strict news parallel-fetch preserve-libs protect-owned sandbox sfperms strict unknown-features-warn unmerge-logs unmerge-orphans userfetch userpriv usersandbox usersync xattr"
FFLAGS="-O2 -pipe"
GENTOO_MIRRORS="http://ftp.uni-erlangen.de/pub/mirrors/gentoo http://gentoo.mirror.solnet.ch http://gd.tuwien.ac.at/opsys/linux/gentoo http://ftp-stud.fht-esslingen.de/pub/Mirrors/gentoo"
LANG="de_DE.UTF8"
LC_ALL="de_DE.utf8"
LDFLAGS="-Wl,-O1 -Wl,--as-needed"
LINGUAS="de"
MAKEOPTS="-j5"
PKGDIR="/usr/portage/packages"
PORTAGE_CONFIGROOT="/"
PORTAGE_RSYNC_OPTS="--recursive --links --safe-links --perms --times --omit-dir-times --compress --force --whole-file --delete --stats --human-readable --timeout=180 --exclude=/distfiles --exclude=/local --exclude=/packages --exclude=/.git"
PORTAGE_TMPDIR="/var/tmp"
USE="X a52 aac ac3 acl acpi activities alsa alsa-plugin amd64 asyncns bash-completion berkdb bluetooth branding bzip2 cairo caps cdda cdr cli consolekit crypt cups cxx dbus declarative directfb divx dri dts dvb dvd dvdr dvdread emboss encode exif fam ffmpeg firefox flac fortran gdbm gif glamor glib gpm gtk iconv ip1000 ipv6 irmc java javafx jpeg kde kipi kwallet lcms ldap libnotify libtirpc mad matroska mmx mng mp3 mp4 mpeg multilib ncurses nls nptl nptlonly ntfs nvidia ogg openal opengl openmp pam pango pcre pdf phonon plasma png policykit ppds pulseaudio python qml qt5 quicktime readline real restrict-javascript rss samba sdl seccomp semantic-desktop smt spell sse sse2 ssl ssse3 startup-notification svg tcpd theora threads tiff tools truetype udev udisks unicode upower usb v4l v4l2 vdpau vorbis widgets win32codecs wxwidgets x264 xattr xcb xcomposite xml xv xvid zlib" ABI_X86="64" ALSA_CARDS="ali5451 als4000 atiixp atiixp-modem bt87x ca0106 cmipci emu10k1x ens1370 ens1371 es1938 es1968 fm801 hda-intel intel8x0 intel8x0m maestro3 trident usb-audio via82xx via82xx-modem ymfpci" APACHE2_MODULES="authn_core authz_core socache_shmcb unixd actions alias auth_basic authn_alias authn_anon authn_dbm authn_default authn_file authz_dbm authz_default authz_groupfile authz_host authz_owner authz_user autoindex cache cgi cgid dav dav_fs dav_lock deflate dir disk_cache env expires ext_filter file_cache filter headers include info log_config logio mem_cache mime mime_magic negotiation rewrite setenvif speling status unique_id userdir usertrack vhost_alias" CALLIGRA_FEATURES="karbon plan sheets stage words" COLLECTD_PLUGINS="df interface irq load memory rrdtool swap syslog" CPU_FLAGS_X86="mmx mmxext sse sse2 sse3 ssse3" ELIBC="glibc" GPSD_PROTOCOLS="ashtech aivdm earthmate evermore fv18 garmin garmintxt gpsclock isync itrax mtk3301 nmea ntrip navcom oceanserver oldstyle oncore rtcm104v2 rtcm104v3 sirf skytraq superstar2 timing tsip tripmate tnt ublox ubx" INPUT_DEVICES="libinput keyboard mouse" KERNEL="linux" L10N="de" LCD_DEVICES="bayrad cfontz cfontz633 glk hd44780 lb216 lcdm001 mtxorb ncurses text" LIBREOFFICE_EXTENSIONS="presenter-console presenter-minimizer" OFFICE_IMPLEMENTATION="libreoffice" PHP_TARGETS="php5-6 php7-1" POSTGRES_TARGETS="postgres9_5 postgres10" PYTHON_SINGLE_TARGET="python3_6" PYTHON_TARGETS="python2_7 python3_6" RUBY_TARGETS="ruby23 ruby24" USERLAND="GNU" VIDEO_CARDS="nvidia" XTABLES_ADDONS="quota2 psd pknock lscan length2 ipv4options ipset ipp2p iface geoip fuzzy condition tee tarpit sysrq steal rawnat logmark ipmark dhcpmac delude chaos account"
Unset:  CC, CPPFLAGS, CTARGET, CXX, INSTALL_MASK, PORTAGE_BINHOST, PORTAGE_BUNZIP2_COMMAND, PORTAGE_COMPRESS, PORTAGE_COMPRESS_FLAGS, PORTAGE_RSYNC_EXTRA_OPTS


Danke!
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firefly
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PostPosted: Thu Dec 06, 2018 6:55 pm    Post subject: Reply with quote

Quote:
RssShmem: 5058932 kB

Da gibt es ein haufen resident shmen memory (Aus der docu von proc: SysV shm, mapping of tmpfs and shared anonymous mappings)

Veringern sich die Werte, wenn du alle GUI applikationen schließt (z.b. browser und co)
Ich konnte bei einer internet suche folgendes finden: https://unix.stackexchange.com/questions/265428/extremely-high-shmem-usage
und da war google chrome das problem das es bei langer laufzeit memory leaked.

Eventuell ist es hier was ähnliches wobei der leak in Xorg prozess stattfindet, eventuell durch den nvidia Treiber ausgelöst?
_________________
Ein Ring, sie zu knechten, sie alle zu finden,
Ins Dunkel zu treiben und ewig zu binden
Im Lande Mordor, wo die Schatten drohn.
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mike155
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Joined: 17 Sep 2010
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PostPosted: Thu Dec 06, 2018 7:51 pm    Post subject: Reply with quote

Ich stimme firefly zu, dass die Werte von VmRSS und RssShmem sehr hoch sind.

Bei dem Rechner von mattes sind sie:
Code:
VmRSS:      5103848 kB
RssShmem:   5058932 kB

Zum Vergleich: bei mir sind sie zurzeit (Intel GPU; X+Wayland, KDE, Firefox und Thunderbird geöffnet):
Code:
VmRSS:     71440 kB
RssShmem:  35292 kB

1) Werden die Werte wieder niedriger, wenn Du alle Anwendungen (Firefox, Chrome, Eclipse, usw.) schließt? Oder bleiben Sie auf einem hohen Wert stehen? Vielleicht kannst Du herausfinden, bei welcher Anwendung diese beiden Werte stark ansteigen?

2) Ich tippe darauf, dass es etwas mit dem nvidia-Treiber zu tun hat. Tritt das Problem auch mit der neuesten im Tree verfügbaren Version 415.18 auf? Oder mit der ältesten Version 304.137 auf?
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mattes
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PostPosted: Thu Dec 06, 2018 8:25 pm    Post subject: Reply with quote

nach dem schließen der einzigen laufenden Anwendung Firefox (außer kde und Dienste) ist es nun:
RssShmem: 5898632 kB

Wenn ich irgendeine Anwendung öffne steigt der Wert, wenn ich die schließe steigt er auch :?

Nach öffnen und schließen von kdeSVN (und vorigem Öffnen von Firefox um das hier zu schreiben):
RssShmem: 6129004 kB

Ich muss beim nvidia Triber bei der 390er Reihe bleiben, >390 unterstützen meinen Grafikchip nicht mehr.
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mike155
l33t
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Joined: 17 Sep 2010
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Location: Frankfurt, Germany

PostPosted: Thu Dec 06, 2018 8:33 pm    Post subject: Reply with quote

Quote:
Ich muss beim nvidia Treiber bei der 390er Reihe bleiben, >390 unterstützen meinen Grafikchip nicht mehr.

Kannst Du einen älteren Treiber testen (z.B. 304, 340, 375)?
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mattes
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Joined: 23 Jul 2008
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PostPosted: Thu Dec 06, 2018 9:15 pm    Post subject: Reply with quote

nicht so einfach, hab ich auch versucht, aber das zieht einen ganzen Schwnz an abhängigkeiten nach sich (xorg <1.20, ...).
Wie aufwändig ist es denn den open source triber zu testen?
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mattes
Apprentice
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Joined: 23 Jul 2008
Posts: 254
Location: München, Bavaria, Germany

PostPosted: Fri Dec 07, 2018 7:40 pm    Post subject: Reply with quote

Habe jetzt mal den nouveau Treiber installiert (alternativer Kernel, zum wahlweisen start) und teste ob es damit weg ist..
sieht erstmal gut aus:
Code:

cat /proc/4936/status | grep Shmem
RssShmem:          36096 kB
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