Ciao grazie per i comandi: ora sappiamo meglio che tipo di sistema hai.
Allora per chiarezza ti si consigliava di partizionare. Puoi postare anche l'output di:
**warning** leggi tutto, leggi bene, se non ti è chiaro qualcosa chiedi prima di farlo: ciò che fai sui tuoi sistemi è tua sola responsabilità
patti chiari amicizia lunga 
Come passi preliminari io riorganizzerei le partizioni così :
come root, da ubuntu
modifica il file
e commenti la riga relativa alla swap
poi lanci
e cancelli tutte le partizioni, ad eccezione di /dev/sda1 [che è quella su cui risiede ubuntu].
salva e riavvia il sisitema per verificare che tutto funzioni ancora.
Se tutto riparte, sempre da root, sempre da ubuntu, sempre con fdisk ricrea 2 partizioni, sda2 per gentoo e sda3 per la swap, entrambe della dimensione che vorrai. Tieni conto che se poi vorrai installare altro o creare delle partizioni comuni tra i 2 OS potrai crearne 1 primaria, oppure 1 estesa all'interno della quale potrai crearne più di una logica. [lo specifico per chiarezza].
Fatto ciò, potrai seguire l'handbook d'installazione sapendo che :
a) farai tutto su una sola partizione
b) la tua root partition sarà sda2 e la swap sda3